Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms