Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF4A3P38919 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF4A3P38919 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF4A3P38919 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF4A3P38919 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms