Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms