Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPS1P31327 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPS1P31327 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPS1P31327 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPS1P31327 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPS1P31327 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPS1P31327 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPS1P31327 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPS1P31327 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms