Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERCC5P28715 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERCC5P28715 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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