Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLD1P28340 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLD1P28340 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLD1P28340 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLD1P28340 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms