Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCD3P28288 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms