Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALML3P27482 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALML3P27482 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALML3P27482 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALML3P27482 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALML3P27482 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALML3P27482 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms