Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTX3P26022 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTX3P26022 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms