Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO1P25800 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO1P25800 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO1P25800 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO1P25800 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO1P25800 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO1P25800 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO1P25800 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms