Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRBP23467 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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