Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
EPHA1P21709 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms