Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCP20941 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCP20941 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCP20941 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCP20941 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCP20941 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms