Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB1P20618 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms