Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCFC2P16383 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms