Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms