Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODC1P11926 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODC1P11926 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms