Protein–RNA interactions for Protein: P11142

HSPA8, Heat shock cognate 71 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA8P11142 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA8P11142 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms