Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms