Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGA3P0DJD8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms