Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC175P0C221 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms