Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRCP08575 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRCP08575 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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