Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTA1P02549 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms