Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LTAP01374 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LTAP01374 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LTAP01374 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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LTAP01374 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LTAP01374 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LTAP01374 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LTAP01374 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LTAP01374 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LTAP01374 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LTAP01374 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LTAP01374 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LTAP01374 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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