Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD2O96028 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD2O96028 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSD2O96028 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NSD2O96028 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSD2O96028 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSD2O96028 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSD2O96028 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSD2O96028 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSD2O96028 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSD2O96028 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSD2O96028 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSD2O96028 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSD2O96028 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NSD2O96028 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSD2O96028 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NSD2O96028 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms