Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECM2O94769 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECM2O94769 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECM2O94769 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms