Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGR5O75473 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGR5O75473 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGR5O75473 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGR5O75473 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR5O75473 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms