Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTNBO60941 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DTNBO60941 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTNBO60941 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTNBO60941 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTNBO60941 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTNBO60941 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTNBO60941 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTNBO60941 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTNBO60941 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms