Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA2O43921 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms