Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYNGR3O43761 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms