Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRC1O43663 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRC1O43663 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRC1O43663 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRC1O43663 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRC1O43663 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRC1O43663 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRC1O43663 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms