Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SYNJ1O43426 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ1O43426 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms