Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEFVO15553 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEFVO15553 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEFVO15553 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEFVO15553 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEFVO15553 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms