Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TO15178 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TO15178 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TO15178 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TO15178 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TO15178 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TO15178 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TO15178 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TO15178 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms