Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A2O14975 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A2O14975 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms