Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAMP3O14828 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms