Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PHOX2AO14813 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms