Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTDSP2O14595 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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