Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms