Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIK3C2AO00443 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIK3C2AO00443 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms