Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN34H7C241 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN34H7C241 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms