Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H7C1C5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H7C1C5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H7C1C5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H7C1C5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H7C1C5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H7C1C5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H7C1C5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H7C1C5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H7C1C5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms