Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UPK3BL2E5RIL1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UPK3BL2E5RIL1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms