Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf172C9J069 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf172C9J069 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms