Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HMGB1P1B2RPK0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms