Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPBD1B2RD01 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms