Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3BA8MYP8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms