Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
NEURL1BA8MQ27 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEURL1BA8MQ27 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms