Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPVL3A0A0U1RRI6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms