Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CEP44Q9C0F1 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CEP44Q9C0F1 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CEP44Q9C0F1 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CEP44Q9C0F1 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CEP44Q9C0F1 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CEP44Q9C0F1 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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